如何检测RNA的稳定性 放线菌素d rna降解
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一、如何检测RNA的稳定性
检测RNA稳定性的方法是放线菌素D能在几分钟内被细胞吸收,并优先嵌入富含GC的DNA序列中,形成稳定的复合物,抑制所有真核RNA聚合酶的转录过程。用放线菌素D处理不同时间后,检测靶RNA的分子水平,计算靶RNA的半衰期,并评价其稳定性。该实验是研究RNA分子转录后调控的常用方法之一。主要信息:
RNA的分子结构之所以能稳定,是因为碱基配对降低了能量。所以最小自由能算法认为RNA真正的二级结构是自由能趋于最小值的时候。大部分RNA是单链分子,单链可以自行折叠形成发夹状结构,具有局部双螺旋结构的特征,这是各种RAN空间结构的共同特征。
RNA局部双螺旋结构中碱基的互补配对规则是A对U,G对C,由于RNA分子内部不能完全形成碱基配对,其碱基摩尔比A不等于U,G不等于C,所以不存在DNA碱基比Chargaff定律。
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