探索处于生物研究核心的化合物的质量

帮助生物医学研究人员使用最好的小分子试剂进行实验的主要更新在线资源的详细信息已经发布。ChemicalProbesPortal提供对化学探针(通常是蛋白质抑制剂)的专家评论，为研究人员提供免费的专家建议，帮助他们了解为实验选择哪些工具化合物，以及如何最好地使用它们。现在，发表在NucleicAcidsResearch上的一篇新论文向科学界更新了门户网站的大幅增强版本的开发情况，并为研究人员提供了使用该门户网站时可以引用的参考。

生物医学难题

化学试剂(最常见的是蛋白质抑制剂)的选择和使用不当在2015年被一大批化学探针专家强调为生物医学研究中的一个主要和普遍的难题。

时至今日仍然存在的常见问题包括使用有缺陷的化合物，这些化合物对感兴趣的蛋白质没有选择性，甚至可能高度混杂，从而导致错误的研究结论。

一种解决方案是化学探针门户网站，由化学生物学和药物发现专家创建此在线网络资源，旨在提高生物医学研究(包括药物发现)的质量和稳健性。

增强的门户

尽管较早的论文宣布了门户网站的最初推出，当时还处于雏形，但新出版物为大大增强的门户网站提供了更全面的内容的具体参考。

研究界现在可以查阅和引用这篇新论文，该论文还概述了支持该网站并提供更好性能和用户体验的增强型前端和后端系统和流程。

高质量的化学探针是小分子——不仅包括蛋白质抑制剂，现在还包括降解剂和其他蛋白质调节剂——可以放心地使用它们来询问特定蛋白质在活细胞内的功能。

探针使我们能够了解基本的生物过程，并阐明疾病机制和开发潜在的治疗方法。

新探头

位于癌症研究所的最新版ChemicalProbesPortal提供了关于500多种化学探针化合物的详细信息和专家评论，以帮助研究人员研究400多种人类蛋白质靶点，这些靶点涉及广泛的生物学研究通路和疾病，包括癌症、糖尿病、关节炎和神经退化。

这篇新论文描述了门户网站上的最新功能，包括许多新化合物，以及支持科学家为其蛋白质选择正确抑制剂并适当使用它们的有用指南。

即使是高质量的化学探针也只有在以正确的方式使用时才有用，尤其是在正确的浓度下并且最好与适当的对照化合物一起使用。

还鼓励科学家使用改进的门户流程提交新化合物以供门户的大型科学专家评审小组(SERP)评审，并建议可以涵盖的感兴趣的蛋白质。

另一个新功能是可以选择下载门户数据库或经过筛选的探针选择。支持所有这一切的是新的基础设施，包括一个新的数据库，随着新化合物的发现和合并，这将使门户网站呈指数级增长。

专家评审

200名SERP成员是化学生物学、药理学和药物化学评论方面的专家，他们自愿对每种化合物进行审查和评级，并就其在研究蛋白质靶标中的应用提供评论和建议。

不断添加新的化合物，并且随着继续开发更多的高质量化合物，这个数字将会增加。

ChemicalProbesPortal与StructuralGenomicsConsortium和Target2035密切合作，Target2035是一项开放科学全球运动，旨在推动研究人类蛋白质的化学和生物学工具的发展，目标是到2035年为每种人类蛋白质开发一种工具.

选择合适的探头

世界各地的研究人员仍在使用表征不佳的化合物，即使有新的、更好的化合物可用。使用错误的分子，例如广泛的激酶抑制剂(如星形孢菌素)而不是感兴趣的蛋白质的选择性抑制剂，使得无法了解细胞中发生的事情，因为多个目标同时受到影响。从关于探针选择性的错误假设开始，将使所有未来的研究都处于危险之中。

该门户网站运营总监兼法兰克福结构基因组学联盟首席运营官SusanneMüller-Knapp博士说：“组成我们科学专家评审小组的200名专家使该门户网站成为独一无二的专家资源。他们的评论提供有关如何使用特定化合物的关键信息、需要注意的任何问题，或者在特定实验中自信地使用探针之前需要哪些额外数据。

“这种专业知识和建议通过我们的平台免费提供给任何希望使用抑制剂或工具化合物来研究蛋白质功能的生物学家。”

ICR药理学和治疗学Harrap教授兼化学探针门户执行主任PaulWorkman教授补充说：“化学探针是了解蛋白质功能和如何治疗疾病的强大工具，但在实验中使用不当可能会导致误导或完全错误的结论。

“ChemicalProbesPortal是生物医学研究界的免费资源，可为实验中使用的最佳可用工具提供专家指导——那些符合标准的工具，例如对所需蛋白质的高度选择性、该蛋白质的调制证据在活细胞中发挥功能并且没有脱靶毒性。

“门户网站上的新发展现在将进一步改进可用于实验研究的最佳工具的选择和使用，从而提高生物医学研究和药物发现的质量和稳健性。”