新的宏基因组研究揭示了抗菌素耐药性的全球格局
在抗性基因出现的频率和发现基因的细菌类型方面存在很大的地理差异。对全球污水的分析表明了这一点,从而强调了根据当地条件的数据对抗抗菌素耐药性的重要性。
在大流行期间,全世界都意识到使用污水分析来监测一个地区疾病发展的价值。然而,在DTU国家食品研究所,一组研究人员自2016年以来一直在使用来自世界各地的污水监测作为监测传染病和抗菌素耐药性的有效且廉价的工具。
通过分析DTU在2016年至2019年间从101个国家的243个城市接收的污水样本,研究人员现已绘制出世界上耐药基因发生率最高的地区、这些基因的定位方式以及它们在哪些类型的细菌中被发现.
刚刚发表在NatureCommunications上的新宏基因组研究的结果令研究人员感到惊讶。事实上,该研究表明,这些基因出现在许多不同的遗传环境和细菌类型中,表明传播比研究人员预期的要大。
我们在高度不同的细菌类型中发现了相似的抗性基因。当基因可以从一个非常广泛的细菌群传到一个完全不同的、没有相似之处的群落时,我们发现它令人担忧。这些基因传输发生在如此长的距离上是罕见的。这有点像非常不同的动物物种产生后代。”
如果这些基因存在于通常不会让人生病的细菌中——例如乳酸菌——则不必担心。然而,如果耐药基因进入对人类健康很重要的细菌——例如沙门氏菌——,那就完全不同了。
“这使得细菌更有可能真正杀死人——例如在医院——因为没有可用的治疗方法,”PatrickMunk强调说。
抗性基因传播的热点
在撒哈拉以南非洲的不同地方,研究人员在许多不同的细菌中发现了相同的抗性基因。
“我们将这解释为意味着我们可能非常接近传播热点,那里有基因从一种细菌传播到另一种细菌再到第三种细菌。这就是为什么我们在这么多不同的背景下恰好在那里看到基因,”帕特里克蒙克解释道。
他补充说,许多令人惊讶的传播似乎发生在撒哈拉以南非洲地区。这些也是抗药性监测项目最不发达的国家,这意味着抗药性情况的数据非常少。
“我们有可能忽视重要趋势,因为我们没有数据,”他建议道,并强调可靠的数据正是制定有效的抗击阻力战略所需要的:
“现在,我们对抵抗力在西方的表现有丰富的了解,并且——基于这些知识——我们计划如何对抗抵抗力。现在事实证明,如果我们观察一些新的地点,抵抗力基因可能表现得非常好不同——大概是因为它们有更有利的传播条件。因此,对抗耐药性的方式也必须因地制宜地进行调整和调整。”
接班人
由诺和诺德基金会和VEO研究项目支持的全球污水项目将于2023年结束。研究人员发现,它已被证明是对主要在国家或地区层面运作的现有监测计划的良好补充并测量病人细菌的耐药性。
因此,他们希望该项目的继任者能够出现,以便世界能够继续受益于监测计划产生的重要知识。这也适用于拥有可靠监测计划和控制策略的国家。
“气候变化有很多类比,地球另一端发生的事情对你来说并非不重要。总有一天,这个问题会回来咬我们,正如我们一次又一次看到的那样,”PatrickMunk强调。
在这项研究中,研究人员分析了来自101个国家243个城市的757个污水样本。这些样本是在2016年至2019年间收集并发送到DTU位于Lyngby的校园的。
相对于您可以覆盖的人数而言,废水的基因组分析是快速且相当便宜的。废水分析不需要伦理批准,因为样品材料不能与个人联系起来。
在NatureCommunications上的一篇文章中阅读有关该研究结果的更多信息:来自101个国家/地区的污水的基因组分析揭示了全球抗菌素耐药性格局。
这项工作是在诺和诺德基金会和VEO研究项目的资助下进行的。
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