完整的叶绿体基因组阐明了六种黄精的系统发育位置

黄精因其具有水平匍匐的肉质根的药用价值而受到高度重视。以往的研究主要集中在质体基因组的大小和基因含量上，对比较基因组分析的研究不足。此外，一些物种的完整叶绿体基因组数据尚未公布，因此它们的系统发育位置尚不清楚。

中科院武汉植物园胡光万教授课题组首次报道了风铃草的叶绿体全基因组，随后对6种黄精的叶绿体全基因组进行了比较和系统发育分析。

黄精的叶绿体基因组呈典型的四联结构，长度在154,564~156,028bp之间。在每个物种中检测到总共113个独特基因。比较分析表明，黄精和异黄精的叶绿体基因组在基因组大小、基因含量、基因顺序和鸟嘌呤-胞嘧啶含量方面保持了较高的相似性。

除P.sibiricum1外，所有物种均未显示IR边界的显着收缩或扩展，其中rps19基因由于不完全复制而被证明是假基因。在每个基因组中检测到丰富的长分散重复和简单序列重复。

发现五个高度可变区域是潜在的特异性DNA条形码，并且揭示了14个基因处于正选择下并且识别出大量重复序列。

62条黄精及其近缘种叶绿体序列被用于系统发育分析。结果表明，黄精可分为两个重要的进化枝，sect.Verticillata和sect.西伯利亚加教派。玉竹。

此外，强烈支持P.campanulatum和P.tessellatum+P.oppositifolium为姊妹种并归入sect。Verticillata，表明叶片排列似乎不是划定玉竹亚属群的合适基础。

此外，P.franchetii也是P.stenophyllum的姐妹。轮藻也。

本研究提供了更多的黄精叶绿体基因组信息，有助于进一步完善物种鉴定和系统发育研究。