研究人员发现冷藏或风干土壤样本以供未来研究可以保留重要的微生物细节
田纳西大学诺克斯维尔分校生态与进化生物学系的博士后研究员乔·爱德华兹和研究生莎拉·洛夫今年春天发表了已发表的研究结果,这些发现可以为其他研究人员在储存土壤样本以备后用时节省大量时间和精力。研究其微生物含量。
长期以来,用于微生物研究的储存土壤样本的首选方法一直是冷冻它们,以保持DNA完整,以供未来可能需要提取信息的研究使用。缺点是需要为这些冰柜供电并维护容纳它们的设施。
Edwards和Love研究了大量的土壤样本。他们的分析表明,在冷藏或风干条件下储存的土壤在多年内仍能保留了解微生物群落组成和结构所需的信息。
爱德华兹说:“我们想证明这些风干的土壤对于了解土壤微生物群落仍然有用。”“我们正在使用国家存档数据库中的干燥土壤微生物来研究真菌群落的长期、全大陆的空间模式,并将其与所有相同地块的森林普查数据进行比较。”
这个土壤数据库存储了某个地区长期生态变化的历史。研究人员希望用相对较新的方法研究这些土壤,在微生物层面上建立真菌生态变化的时间表。
“这种微生物测序技术可能只出现了10到15年左右,”Edwards说。“我们对这些微生物组没有非常长期的轨迹。这些档案的一个很酷的事情是它们被多次采样,所以我们进行了多次重采样。我们可以看看这些微生物组随着时间的推移发生了多少变化,并得到他们的历史模式,这实际上是还没有人做过的事情。”
爱德华兹和洛夫发现的结果表明,干燥储存的土壤样本对于研究土壤性质和真菌群落在较长时期(可能长达数十年)如何变化非常有用。
“我们在报纸上所说的有点微妙,”爱德华兹说。“我们设法维持了微生物群落中所解释的环境差异。如果你只是想随着时间的推移跟踪真菌的特定分类群,那么该方法不太可靠。但如果要研究群落多样性和群落的广泛模式,那么这种方法就不太可靠。组成,它很有用,我们可以很好地了解这些社区随空间和时间变化的整体形状。”
了解可用存档信息的可靠性可以帮助未来的研究人员知道他们的样本将为他们提供所需的准确数据。
爱德华兹和洛夫将把这些发现应用到他们自己的土壤研究的下一阶段:对全国各地数千个风干土壤进行测序。他们发现的信息可以为长期的全球变化模式提供重要的新理解。
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