提到菌类,大多数人可能会想到他们在秋天采摘的蘑菇,或者他们在烘烤或酿酒时添加的酵母。其他人可能会想起上周发霉的面包——或者冰箱里变质的黄瓜。事实上,几个世纪以来,真菌学家一直在研究这些真菌,将其作为食物和发酵的来源,但同时也是腐烂和疾病的来源。

所有的真菌都重要吗是的新的研究认为

但是,虽然我们习惯于将真菌视为形成子实体等物理结构的有机体,或我们可以在厨房或实验室中培养的类似酵母的生命形式,但逐渐清楚的是,真菌并不容易分类只有这两组。对土壤等环境基质的 DNA 测序研究发现大量证据表明,大量真菌似乎不会形成子实体,而且我们似乎无法在实验室中生长——但它们仍然存在。这些群体通常被称为“暗真菌”,类似于天文学中的“暗物质”概念——我们知道它就在那里,但我们现在不能直接观察到。

MycoKeys的一项新研究对比了使用传统真菌学方法恢复的真菌物种的积累与使用环境 DNA 测序随时间恢复的真菌物种的积累。即使考虑到各种偏差,作者发现通过环境测序发现的物种在过去五年中以强劲增长的趋势大大超过了传统的物种恢复。作者得出结论,深色真菌构成了真菌王国的一个决定性特征。

“这就是它变得有趣的地方”,瑞典哥德堡大学的 Henrik Nilsson和该研究的主要作者说。“根据目前的命名规则,这些真菌不能被赋予科学名称——它们不能被正式描述。无法正式命名的物种和群体,嗯,它们往往落在裂缝之间。它们通常不会被纳入自然保护计划。它们经常被排除在估计真菌进化历史的努力之外,当我们试图弄清楚质量和能量如何在生态系统中流动时,它们的生态作用和关联在很大程度上被忽视了。他们基本上被当作不存在一样对待。”

瑞典乌普萨拉大学的第二作者 Martin Ryberg插话道:“这并不是说我们要将几块缺失的部分添加到一个几乎完整的拼图游戏中。这似乎是相反的。我们谈论的是数十大类真菌 - 以及成千上万的物种,其中一些似乎非常普遍,以至于我们还没有找到它们不存在的土壤样本。事实上,我们正在谈论的是什么很可能被证明是真菌王国中占主导地位的生活方式。”

真菌学界一直在争论是否应该修改真菌命名规则以允许对这些深色真菌进行正式描述。到目前为止,此事还没有得到肯定的解决。“我认为我们的研究表明是时候停止这场辩论了,就像,马上,”尼尔森说。“我们应该争论的是我们应该如何描述它们。黑木耳必须满足什么标准才能获得正式的学名?显然,子实体的形成或在实验室中的生长不能成为这些标准的一部分。”

奥地利维也纳大学的合著者 Alice Retter解释说,“我们认为我们将启动如何通过列出我们认为有意义的标准进行辩论——这些标准足够严格,只允许描述经过特别严格审查的暗色真菌,在这个过程中保持高水平的科学严谨性和可重复性。我们将自己的观察与真菌学界的建议相结合,这些建议是从 bioRxiv 上存放的手稿预印本中挑选出来的。我们当然不是在声称我们的建议构成了辩论的最终结论。这更像是他们是第一个。我们认为真菌学界将能够就此事共同提出一套合理的指导原则——这是对成核作用的一组初步的善意观察。”

作者提倡对管理真菌命名的命名规则进行温和修改,以允许至少为记录最完备的物种和暗色真菌群赋予正式名称。目前,建议的修改将从正式描述中排除许多稀有或其他记录较少的暗色真菌。

爱沙尼亚塔尔图自然历史博物馆的资深作者 Kessy Abarenkov断言:“但你不必拥有关于一切的理论才能拥有某事的理论。” “通过为描述暗色真菌所需的内容制定规则,并指定我们目前必须避免描述此类物种的时间,真菌学家可以做他们最擅长的事情:顽强地收集足够的研究数据以保证命名暗色真菌,组按组,按物种。数百年来,这正是真菌学所擅长的。只是设置有点新。”

塔尔图大学的Sten Anslan继续说道:“显然,事关重大。长期以来,现行的真菌命名规则一直为真菌学服务。我们不想颠覆或推翻它们。但我们担心,如果它们在这方面没有得到更新,随着时间的推移,它们可能会变得越来越过时。从长远来看,拥有一本规则书可能只管理它最初设想要管理的有机体的百分之几——真菌王国——这似乎是站不住脚的。”

瑞典农业大学的 Marisol Sanchez-Garcia总结道:“暗色真菌的命名方面可能会在明年于荷兰马斯特里赫特举行的国际真菌学大会上进行详细讨论。我们希望真菌学界能够就将深色真菌纳入命名规则达成有意义的协议。毕竟,真菌学家习惯于在日常的基础上协商和解决重要的问题,而这个几乎没有什么不同。作为解决一个巨大的、或多或少不为人知的生物群体的一部分,在这些生物群体中,几乎没有什么是一成不变的,而且规则必须随着时间的推移而调整,以便努力与最近的发展保持一致,好吧,在我看来,这就是成为一名真菌学家如此有趣和有益的原因。”