研究人员对myxini的第一个基因组进行了测序这是唯一没有参考基因组的脊椎动物谱系
由马拉加大学胡安·帕斯夸尔·阿纳亚(JuanPascualAnaya)的一名研究人员领导的一个由来自7个不同国家的40多名作者组成的国际科学小组,成功地对粘盲鳗(也称为粘盲鳗)的第一个基因组进行了测序,盲鳗是唯一的大型脊椎动物类群。目前还没有任何其物种的参考基因组。
这一发现发表在《自然生态与进化》杂志上,有助于破译脊椎动物(包括人类在内的一个群体)祖先中发生的基因组重复的进化历史。
“这项研究在进化和分子领域具有重要意义,因为它有助于我们了解伴随脊椎动物起源的基因组变化及其最独特的结构,例如复杂的大脑、下巴和四肢,”解释说UMAPascualAnaya动物生物学系科学家负责协调这项研究。
因此,这项历时近十年的研究是由一个国际联盟进行的,该联盟包括来自西班牙、英国、日本、中国、意大利、挪威和美国的30多个机构,其中包括东京大学、日本研究机构RIKEN、中国科学院和巴塞罗那基因组调控中心等。
米西尼是一群栖息在深海区域的动物。它们因感到受到威胁时释放的粘膜量而闻名,这是化妆品公司研究的重点,也因其作为海底生态纽带的作用而闻名(因为它们是食腐动物,负责清除尸体等)死后最终沉入海底的鲸鱼),到目前为止,由于其复杂性,它们的基因组尚未被测序。
它们由大量微染色体组成,而微染色体又由重复序列组成。这还不包括获取生物材料的困难。
“此外,这些微染色体在动物发育过程中会丢失,因此只有生殖器官才能维持完整的基因组,”胡安·帕斯夸尔·阿纳亚(JuanPascualAnaya)说。
在这项研究中,测序的基因组是生活在太平洋东亚海岸的EptatretusBurgeri的基因组。为了实现这一目标,研究人员使用先进的染色体邻近技术(Hi-C)生成了高达基因组大小400倍的数据,并设法在染色体水平上进行组装。
“这很重要,因为它使我们能够比较该脊椎动物与其他脊椎动物(包括鲨鱼和人类)之间的基因顺序,从而解决基因组进化中最重要的公开辩论之一:基因组重复的数量,并且当这些发生在不同脊椎动物谱系的起源期间时,”马萨诸塞大学科学家说,他补充说,由于这一点,我们现在知道所有脊椎动物的共同祖先都源自一个基因组完全复制过一次的物种。
后来,根据帕斯夸尔·阿纳亚(PascualAnaya)的说法,产生现代下颌脊椎动物和非下颌脊椎动物的谱系分开了,每一种都独立地重新繁殖了自己的基因组:前者(包括人类)复制了它,后者则将其基因组增加了两倍。
日本理化学研究所ShigeruKuratani教授的实验室基于极其罕见的myxini胚胎样本对基因组功能进行了分析;与布里斯托大学教授和英国皇家学会会员菲尔·多诺霍(PhilDonoghue)共同开发的一项关于基因组重复对每种脊椎动物可能产生的影响的研究,完成了这项对于理解脊椎动物进化史至关重要的多学科研究。
这项研究提供了对基因组事件的看法,这些事件可能推动脊椎动物重要特征的出现,例如大脑结构、感觉器官或神经嵴细胞,其中包括调节复杂性的增加(更多数量的开关打开基因)/离开)。
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