人类ALS骨骼肌的转录组学分析揭示了circRNA失调的疾病特异性模式
Aging(MEDLINE/PubMed 列为“ Aging (Albany NY)”,Web of Science 列为“Aging-US”)第 14 卷第 24 期发表了一篇新的研究论文,标题为, “人类 ALS 骨骼肌的转录组学分析揭示了 circRNA 失调的疾病特异性模式。”
环状 RNA 是丰富的共价闭合转录本,通过反向剪接在细胞中产生,并在细胞和发育阶段显示不同的表达模式。虽然它们的功能在很大程度上是未知的,但它们内在的稳定性使它们成为许多疾病中有价值的生物标志物。
在这项新研究中,研究人员Dimitrios Tsitsipatis、Krystyna Mazan-Mamczarz、Ying Si、Allison B. Herman、Jen-Hao Yang、Abhishek Guha、Yulan Piao、Jinshui Fan、Jennifer L. Martindale、Rachel Munk、Xiaoling Yang、Supriyo De, Brijesh K. Singh、Ritchie Ho、Myriam Gorospez和Peter H. King来自美国国立卫生研究院的 国家老龄化研究所、阿拉巴马大学伯明翰分校、伯明翰退伍军人事务医疗中心和Cedars-Sinai 医疗中心着手研究肌萎缩侧索硬化症 (ALS) 中的 circRNA 模式。通过 RNA 测序分析,研究人员首先鉴定出 circRNA 和线性 RNA,它们在 ALS 的骨骼肌活检组织中与正常个体相比具有不同的丰度。
“通过 RT-qPCR 分析,我们证实在 ALS 中有 8 个 circRNA 显着升高,10 个显着减少,而由共享前体 RNA 产生的线性 mRNA 对应物通常没有变化。”
这些 circRNA 中的一些在源自带有 ALS 突变的人类诱导多能干细胞 (iPSC) 的运动神经元中,以及来自 ALS 小鼠模型 (SOD1G93A) 的骨骼肌的不同疾病阶段中也存在差异丰富。有趣的是,在 ALS 患者和 ALS (SOD1G93A) 小鼠的脊髓样本中,一部分在 ALS 肌肉活检中显着升高的 circRNA 子集显着减少。总之,研究人员在 ALS 相关组织(肌肉和脊髓)中发现了差异丰富的 circRNA,这些 circRNA 可以告知 ALS 中的神经肌肉分子程序并指导疗法的开发。
“随着我们研究的推进,我们将研究本文报道的 18 种 circRNA 中最有前途和最丰富的 circRNA 的功能。我们对那些似乎对 ALS 具有特异性的化合物特别感兴趣(图 2),因为它们可能有助于表征可作为治疗目标的疾病相关分子通路。”
声明:本站所有文章资源内容,如无特殊说明或标注,均为采集网络资源。如若本站内容侵犯了原著者的合法权益,可联系本站删除。