广泛使用的基因剪刀(CRISPR/Cas)可以修改细胞中的遗传内容以研究基因的分子作用,并在治疗遗传疾病的基因治疗中获得了重要的临床意义。卡罗林斯卡医学院微生物学、细胞和肿瘤生物学系克劳迪娅·库特(ClaudiaKutter)的研究小组进行的一项新研究发现,基因剪刀会导致意想不到的基因组变化。

新研究发现CRISPR/Cas9会导致意想不到的基因组变化

“我们发现CRISPR/Cas9会导致不可预测的靶向基因组效应,从而影响癌细胞的生长。癌细胞没有减慢速度,而是生长得更快。鉴于CRISPR/Cas基因组工程已成为研究和临床应用中的常用工具,我们相信我们新颖的见解,以及我们创新和稳健的方法,将有助于评估基因组变化,”通讯作者、卡罗林斯卡医学院微生物学、细胞和肿瘤生物学系首席研究员克劳迪娅·库特(ClaudiaKutter)说。

研究团队开发了一种新方法来破译高分辨率的基因组变化,并揭示目标位点的不同基因组效应。

“为了解释细胞令人惊讶的表型,我们结合了最新的技术方法。首先,我们在微滴(Xdrop)中专门丰富了我们的目标基因序列。其次,我们通过使用纳米孔长读长测序技术(ONT-LRS)读取基因序列).最后,我们开发了一个复杂的计算管道,可以破译基因组序列的确切变化,”第一作者、博士KeyiGeng说。ClaudiaKutter研究小组的学生。

该论文发表在《基因组研究》上。该研究团队目前正在研究人类细胞中的其他CRISPR/Cas效应,特别关注逃过癌症治疗的癌细胞。

“这有助于我们了解我们的遗传物质在受损时如何修复。尽管CRISPR/Cas非常强大,但我们需要找到更好的方法来控制人体细胞中的CRISPR/Cas活性。因此,使CRISPR/Cas对患者治疗更安全是一个主要问题在我的团队中努力,”克劳迪娅·库特(ClaudiaKutter)说。