研究人员开发了用于识别组织中蛋白质网络的viPCLIP方法

Stoffel小组(IMHS)最近与Tuschl和Chao实验室合作发表的一篇NatureCommunications论文报道了viP-CLIP的开发，这是一种能够识别组织中RBP网络的方法，并识别了一种与胆固醇生物合成调节有关的新因子.

RNA结合蛋白(RBP)是与细胞中的双链或单链RNA结合的蛋白质，在细胞功能、运输和定位中具有重要作用。由于组织交联效率的限制，全系统交联和免疫沉淀(CLIP)方法揭示了主要在培养细胞中限制性商业惯例的调节机制。

IMHS的研究人员开发了viP-CLIP(体内PAR-CLIP)，这是一种能够识别哺乳动物组织中RBP靶标的方法，从而促进了体内RBP调节网络的功能分析。通过将viP-CLIP应用于小鼠肝脏，研究人员将Insig2和ApoB鉴定为突出的TIAL1靶转录物，表明TIAL1在胆固醇合成和分泌中的重要作用。这些目标的功能相关性通过显示TIAL1影响它们在肝细胞中的翻译得到证实。突变体Tial1小鼠表现出改变的胆固醇合成、APOB分泌和血浆胆固醇水平。

该研究表明，viP-CLIP可以通过识别与胆固醇生物合成的负反馈调节有关的先前未被识别的因素来识别生理相关的RBP目标。