基因组研究可能是了解塔斯马尼亚恶魔抗癌能力的关键

过去 30 年来，澳大利亚塔斯马尼亚袋獾种群一直饱受传染性癌症的困扰，导致该物种濒临灭绝。有袋动物非常容易患上袋獾面部肿瘤疾病，这对它们的物种来说几乎总是致命的。该疾病与其宿主之间的基因组相互作用与易感动物在接触病原体后被感染的速度相关。

通过对动物及其肿瘤进行 DNA 测序，南佛罗里达大学综合生物学助理教授 Mark Margres 和博士。学生迪伦·加林森(Dylan Gallinson)追踪了恶魔与癌症之间的基因组相互作用。他们的发现发表在《美国国家科学院院刊》上合着的论文《塔斯马尼亚恶魔与传染性癌症之间共同进化的基因组特征》中。

“生物学中的一个大问题是疾病的遗传基础。确定这一点的经典方法是通过基因组研究和将基因与疾病风险相匹配的回归分析，”马格雷斯说。“以前没有一种技术可以研究两个基因组之间的相互作用。”

利用最近开发的联合全基因组关联研究，Margres 和 Gallinson 评估了 960 个基因组和 15 年捕获袋獾的数据，以追踪袋獾和癌症的共同进化。

“我们在塔斯马尼亚的合作者一直在监测疾病的传播并收集组织样本，”加林森说。“我们对肿瘤和袋獾的 DNA 进行了测序，以找到导致疾病表现的突变。”

他们的发现可以为追踪传染病的流行病学模型和专注于拯救濒危物种的恶魔管理策略提供信息。