化学反应的虚拟探索
一个新的在线平台已经发布,用于探索计算化学反应路径,可以深入理解和设计化学反应。
事实证明,计算化学的进步给反应设计领域带来了巨大的福音,从而发现了合成高价值化合物的新反应途径。计算化学会产生大量数据,组织和可视化这些数据的过程对于能够将其用于未来的研究至关重要。
由北海道大学化学学院 Keisuke Takahashi 教授和化学反应设计与发现研究所 (WPI-ICReDD) Satoshi Maeda 教授领导的研究团队开发了一个集中式、交互式和用户友好的平台,搜索化学作用和网络 (SCAN),探索计算化学产生的反应途径。他们的研究发表在《数字发现》杂志上。
“从计算的角度来看,化学反应可以被认为是由众多分子相互作用组成的极其复杂的网络,”高桥解释道。“已经开发了许多工具来计算这些网络,例如我们在 WPI-ICReDD 中使用的 AFIR 方法。然而,还需要探索这些计算网络的工具,这导致我们进行了当前的研究。”
概括地说,来自 AFIR 计算的所有原始数据形成一个“数据湖”。然后,该数据经过预处理步骤,创建“数据仓库”。最后,“数据集市”从数据仓库中访问和检索数据,并提供工具来可视化、分析和共享检索到的数据。
“预处理步骤至关重要,”前田解释道。“AFIR 的原始数据包含大量信息,必须从中提取 SCAN 平台所需的关键数据。这些关键数据足以创建可搜索和查看的交互式反应路径图。”
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